PARALLELIZATION

• Pourquoi paralleliser un code ?
• OpenMP
  • Présentation de OMP
  • Limitation de OMP
  • Approche utilisée dans MARS: l’approche classique Fine-grain
  • Avantages
  • Inconvénients
  • Compilation
  • Exécution
  • Concept général
  • Etendue d’une région parallèle
  • Partage du travail
  • Variables privées / partagées
  • Lancement d’un job OMP sur Caparmor
• MPI
  • Présentation de MPI
  • Limitation de MPI
  • Compilation
  • Lancement d’un job MPI sur Caparmor
  • Décomposition en domaines
  • Formalisme dans MARS
  • Spécificité ADI
  • Communications collectives et Réductions
  • Diagnostiques
  • Output
  • Moyenne zonale
  • Divers
• MPI+OMP
  • Présentation
  • Codage dans MARS
  • Intérêt
  • Efficacité
  • Compilation
  • Lancement d’un job hybrid sur Caparmor
• debuggage
  • Outils
  • Mode d’emploi du code MARS en mode debug
  • Mode d’emploi du script python compare_seq_mpi.py (travaux M. Honnorat)
• Use on Caparmor
  • PBS command
  • QSUB
  • batch for MPI jobs
  • batch for hybrid jobs
• Variables liées à MPI dans MARS
  • Description transpose_col