Variables diagnostiques (version de base)

Des variables diagnostiques de base sont définies dans le modèle ECOMARS. Leurs noms et dimensions (2D ou 3D) sont lues dans le fichier vardiag.dat. Elles sont calculées au cours du temps soit dans le module biolodyncellwat soit dans le module biolodynzwat :

Warning

Pour l’option 2 : L’exemple de fichier de variables diagnostiques donné dans $HOMEMARS/../EXAMPLES/vardiag_opt2.dat doit être utilisé à la place du vardiag.dat donné dans le repertoire inputs de la configuration. (unités différentes pour les productions cumulées)

+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| Variables diagnostiques   |  dim    |  calcule ou      |             definition                                              |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| maximum_de_diat           |   2     |  biolodynzwat    | concentration max de diatomées sur la colonne d'eau (µmole.L-1)     |
|                           |         |                  | option 1 : calculée à partir de chaque début de mois                |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| date_max_diat             |    2    |  biolodynzwat    | date du max de diatomées sur la colonne d'eau                       |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| profondeur_max_diat       |    2    |  biolodynzwat    | profondeur du max de diatomées sur la colonne d'eau                 |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| maximum_de_dino           |    2    |  biolodynzwat    | concentration max de dinoflagellés sur la colonne d'eau (µmole.L-1) |
|                           |         |                  | option 1 : calculée à partir de chaque début de mois                |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| date_max_dino             |    2    |  biolodynzwat    | date du max de dinoflagellés sur la colonne d'eau                   |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| profondeur_max_dino       |    2    |  biolodynzwat    | profondeur du max de dinoflagellés sur la colonne d'eau             |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| maximum_de_nano           |    2    |  biolodynzwat    | concentration max de nanoplancton sur la colonne d'eau (µmole.L-1)  |
|                           |         |                  | option 1 : calculée à partir de chaque début de mois                |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| date_max_nano             |    2    |  biolodynzwat    | date du max de nanoplancton sur la colonne d'eau                    |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| profondeur_max_nano       |    2    |  biolodynzwat    | profondeur du max de nanoplancton sur la colonne d'eau              |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| grad_vert_salinite        |     2   |  biolodynzwat    | gradient max de salinite rencontré sur la colonne d'eau             |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| profondeur_grad_sal       |     2   |  biolodynzwat    | profondeur du gradient max de salinité rencontré                    |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| grad_vert_temp            |     2   |  biolodynzwat    | gradient max de température rencontré sur la colonne d'eau          |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| profondeur_grad_temp      |     2   |  biolodynzwat    | profondeur du gradient max de température rencontré                 |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_lumiere_diat        |     3   |  biolodyncellwat | effet limitant de la lumière sur la croissance des diatomées        |
|                           |         |                  | moyenne sur la journée de minuit à minuit                           |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_azote_diat          |     3   |  biolodyncellwat | effet limitant de l'azote sur la croissance des diatomées           |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_silice_diat         |      3  |  biolodyncellwat | effet limitant de la silice sur la croissance des diatomées         |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_phosp_diat          |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant du phosphore sur la croissance des diatomées         |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_lumiere_dino        |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant de la lumière sur la croissance des dinoflagellés    |
|                           |         |                  | moyenne sur la journée de minuit à minuit                           |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_azote_dino          |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant de l'azote sur la croissance des dinoflagellés       |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_phosp_dino          |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant du phosphore sur la croissance des dinoflagellés     |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_lumiere_nano        |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant de la lumière sur la croissance du nanoplancton      |
|                           |         |                  | moyenne sur la journée de minuit à minuit                           |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_azote_nano          |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant de l'azote sur la croissance des nanoplancton        |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| effet_phosp_nano          |    3    |  biolodyncellwat | effet limitant du phosphore sur la croissance des nanoplancton      |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| extinction_lumineuse      |    3    |  biolodynzwat    | coefficient d'extinction lumineuse                                  |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_diat                 |    2    |  biolodynzwat    | Production de diatomées cumulée sur chaque colonne d'eau            |
|                           |         |                  |   . option 1 : à partir du 1 janvier  exprime en **Carbone**        |
|                           |         |                  |   . option 2 : depuis le debut de la simulation exprime en **Azote**|
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_dino                 |    2    |  biolodynzwat    | Production de dinoflagellés cumulée sur chaque colonne d'eau        |
|                           |         |                  |   . option 1 : à partir du 1 janvier  exprime en **Carbone**        |
|                           |         |                  |   . option 2 : depuis le debut de la simulation exprime en **Azote**|
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_nano                 |    2    |  biolodynzwat    | Production de nanophytoplancton cumulée sur chaque colonne d'eau    |
|                           |         |                  |   . option 1 : à partir du 1 janvier  exprime en **Carbone**        |
|                           |         |                  |   . option 2 : depuis le debut de la simulation exprime en **Azote**|
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| chlorophylle_a            |    3    |  biolodyncellwat | Concentration en chlorophylle (µg.L-1)                              |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_cumul_chloro         |    2    |  biolodynzwat    | Production totale cumulée sur la hauteur d'eau                      |
|                           |         |                  |    . option 1 :  exprimé en Carbone à partir du 1/01                |
|                           |         |                  |    . option 2 :  exprimé en Azote à partir du 1/01                  |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| wchute_diat               |    3    |  biolodyncellwat | vitesse de chute des diatomées (m/jour)                             |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| wchute_det                |    3    |  biolodyncellwat | vitesse de chute du matériel détritique (m/jour)                    |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| SPIMSPOM                  |    3    |  biolodynzwat    | concentration en matières en supsension totale (mg/L)               |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| Correct_Mes               |    3    |  biolodynzwat    | (utilise si si key_messat) =1 si MES satellite ; =0 si MES simulé   |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_microzooplankton     |    2    |  biolodynzwat    | | Production totale cumulée sur la hauteur d'eau pour microzoo      |
|                           |         |                  | | utilisee seulement si **key_zoo_prod**                            |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_mesozooplankton      |    2    |  biolodynzwat    | | Production totale cumulée sur la hauteur d'eau pour mesozoo       |
|                           |         |                  | | utilisee seulement si **key_zoo_prod**                            |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+
| prod_secondaire_totale    |    2    |  biolodynzwat    | | Production totale cumulée sur la hauteur d'eau du zoo             |
|                           |         |                  | | utilisee seulement si **key_zoo_prod**                            |
+---------------------------+---------+------------------+---------------------------------------------------------------------+